مطالعه ساختار و اندازه موثرجمعیت گاونجدی، هلشتاین وآمیخته‌های آن‌ها با استفاده از پویش کل ژنوم

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران.

2 استاد گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان

3 استادیار گروه علوم دامی دانشگاه زنجان، زنجان، ایران..

10.22034/bilj.2023.417458.1034

چکیده

چکیده:
برای محافظت از نژادهای بومی به منظور حفظ تنوع ژنتیکی، نگهداری حیوان در محل زندگی خود است چرا که هزینه محافظت از ذخایر ژنتیکی بالا بوده و امکان حفظ همه ذخایر ژنتیکی در آزمایشگاه‌ها و موسسات تحقیقاتی ممکن نیست. هدف از این تحقیق مشخص کردن ساختار جمعیتی و اندازه مؤثر جمعیت گاو نجدی، هلشتاین و آمیخته‌های آن‎ها در گله‌های استان خوزستان بود. به این منظور از اطلاعات ژنومی 329 نمونه گاو شامل 141، 60 و 128 نمونه به ترتیب از نژادهای هلشتاین و آمیخته‌ و نجدی استفاده شد. نمونه‌ها با آرایه‌های ژنومی Illumina SNP30K تعیین ژنوتیپ شدند. آنالیز جمعیت با استفاده از PCA و plotNJ انجام شد که در هر دو روش جمعیت‌ها تا حدودی از هم تفکیک شدند. دامنه r2 از 359/0 ± 150/0 26 تا 450/0 ± 244/0 در کروموزوم در 20 برای نژاد هلشتاین و 319/0 ± 130/0 28 تا 462/0 ± 271/0 در کروموزوم 20 در دام‌ه‍ای آمیخته بود، در حالیکه بالاترین مقدار r2 در نژاد نجدی از دامنه 311/0 ± 120/0 28 تا 483/0 ± 271/0 در کروموزوم 20 مشاهده شد. اندازه موثر جمعیت‌ها در نسل پنج برای جمعیت‌های این مطالعه، نجدی 45 راس، آمیخته 101 راس و هلشتاین 110 راس به دست آمد. این اعداد برای گاو نجدی برای مقادیر پیشنهاد شده جهت حفاظت از جمعیت‌ها فاصله زیادی دارد و این امر نشان‌دهنده خطر جدی حذف گاو بومی نجدی در آینده نزدیک است.

کلیدواژه‌ها