@article { author = {Dadpasand, Mohammad and Ranjbar, Sajjad and Blooki, Zahra}, title = {Phylogenetic Analysis of the Neuropeptide VF Gene in Some Mammalian Species}, journal = {Breeding and Improvement of Livestock}, volume = {2}, number = {3}, pages = {69-76}, year = {2022}, publisher = {Agricultural Sciences and Natural Resources University of Khuzestan}, issn = {2645-534X}, eissn = {2645-5358}, doi = {10.22034/bilj.2022.341942.1019}, abstract = {In the present study, the analysis was performed to investigate the evolution of the VF gene in sheep, phylogenetic analysis and natural selection process during the evolution of this gene. The VF gene sequence in sheep and other organisms including cows, goats, and buffalo were sequenced and then aligned to examine each copy of the gene sequence. Percentages of nucleotide substitution and replacement were determined based on the Genome Database Search (NCBI) using maximum likelihood method, phylogenetic tree mapping and natural selection process from bioinformatics studies; The replacement percentage of pyrimidine bases was greater than the purine, indicating a positive selection during the evolution of these genes. The dN / dS ratio was also calculated, indicating a positive evolutionary selection for this gene. This type of dN / dS was purine. The phylogenetic tree for the aforementioned gene in different organisms shows that in general, the VF protein in different organisms is divided into two distinct groups based on their evolutionary pathway, with one similarity in the organisms studied.}, keywords = {Phylogenetic,Gene,neuropeptide VF}, title_fa = {واکاوی فیلوژنی ژن نوروپپتید VF در برخی از گونه‌های پستانداران و پرندگان}, abstract_fa = { در این پژوهش، روند تکامل ژن نوروپپتیدVF در گوسفند، آنالیز فیلوژنی و روند انتخاب طبیعی در طی تکامل این ژن بررسی شد. توالی ژنی VF در گوسفند و سایر گونه‌ها (گاومیش آمریکایی، زبو، گاو اهلی، گاو وحشی هیمالیایی، بوفالو آبی، بز، میمون رزوس، گراز، سگ اهلی، خوک وحشی، اسب، فنچ راه راه، رت، شتر، آلپاکا و مرغ جنگلی سرخ) هم‌تراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها بر اساس جستجو در بانک اطلاعاتی NCBI  با روش حداکثر درست‌نمایی انجام و ترسیم درخت فیلوژنتیک و تعیین روند انتخاب طبیعی حاصل از مطالعات بیوانفورماتیک تعیین شد. درصد جانشینی بازهای پیریمیدینی بیشتر از بازهای پورینی بود، هم‌چنین نسبت dN/dS نیز محاسبه شد که نشان دهنده‌ی ‌انتخاب مثبت در طی تکامل این ژن‌ است. این نوع dN/dS پورینی بود. درخت فیلوژنتیک برای ژن مذکور در موجودات مختلف نشان می‌دهد که پروتئین VF در موجودات مختلف بر اساس مسیر تکاملی خود به دو شاخه مجزا تقسیم می‌شود، که در یک دسته در موجودات مورد مطالعه با درصد شباهت بیشتر قرار گرفته است.}, keywords_fa = {فیلوژنی,انتخاب مثبت,ژن نوروپپتید VF}, url = {https://bilj.asnrukh.ac.ir/article_161073.html}, eprint = {https://bilj.asnrukh.ac.ir/article_161073_0bc1edd811da7d180729ca5115eff12c.pdf} }